Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COG8Q96MW5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COG8Q96MW5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms