Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRRC1Q96M27 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms