Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD4Q96KN9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms