Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPGRIP1Q96KN7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms