Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDLIM2Q96JY6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDLIM2Q96JY6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDLIM2Q96JY6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms