Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHDQ96IW2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHDQ96IW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHDQ96IW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHDQ96IW2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHDQ96IW2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHDQ96IW2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHDQ96IW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHDQ96IW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHDQ96IW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms