Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD1Q96GM5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms