Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EDC3Q96F86 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC3Q96F86 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms