Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM12Q96EX1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms