Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RCN3Q96D15 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RCN3Q96D15 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms