Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX58Q96C10 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms