Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC127Q96BQ5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC127Q96BQ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms