Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VTI1AQ96AJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms