Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPPQ93052 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPPQ93052 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPPQ93052 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPPQ93052 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPPQ93052 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPPQ93052 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPPQ93052 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPPQ93052 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPPQ93052 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPPQ93052 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms