Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF12Q8WXF0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms