Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHIPQ8WWQ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHIPQ8WWQ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms