Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFT2D1Q8WV19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms