Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BRK1Q8WUW1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms