Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF397Q8NF99 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF397Q8NF99 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms