Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC44A5Q8NCS7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A5Q8NCS7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms