Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDH13Q8NBN7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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