Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCL2Q8N4E4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCL2Q8N4E4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms