Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C17orf53Q8N3J3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms