Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SVBPQ8N300 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SVBPQ8N300 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms