Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE1Q8N0S2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms