Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms