Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LCA5Q86VQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms