Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLASP1Q7Z460 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLASP1Q7Z460 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms