Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMC6Q7Z403 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms