Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG9AQ7Z3C6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATG9AQ7Z3C6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms