Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP50Q70EL3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP50Q70EL3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP50Q70EL3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
USP50Q70EL3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP50Q70EL3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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