Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP31Q70CQ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
USP31Q70CQ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
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