Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00299Q6ZSB3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms