Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBP6Q6ZN66 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms