Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CASC2Q6XLA1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms