Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO38Q6PIJ6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO38Q6PIJ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms