Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF449Q6P9G9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF449Q6P9G9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms