Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN1Q6NZI2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms