Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
REEP3Q6NUK4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
REEP3Q6NUK4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms