Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCTP1Q6DN14 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms