Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LHX8Q68G74 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX8Q68G74 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX8Q68G74 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms