Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WSCD1Q658N2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms