Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C9orf57Q5W0N0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf57Q5W0N0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms