Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRAGBQ5VZM2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRAGBQ5VZM2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRAGBQ5VZM2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRAGBQ5VZM2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRAGBQ5VZM2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRAGBQ5VZM2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRAGBQ5VZM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms