Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF38BQ5VTL8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms