Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM78Q5T7P6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms