Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ODF2Q5BJF6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF2Q5BJF6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms