Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RFTN2Q52LD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms