Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO43Q4G163 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO43Q4G163 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms