Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL38Q2WGJ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL38Q2WGJ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms